上海医药行业协会成立于1987年1月5日，是中国医药行业最早成立的地方性医药行业协会之一,是上海民政局首批通过的5A级社会组织，并于2018年再次通过5A级社会组织复评。协会现有会员企业超300家，覆盖医药工业、药品研发、生物医药、制药机械、药品辅料包材、药品流通等医药全产业链及大健康产业，会员企业医药工业产值占上海市医药工业产值比例超过90%。

协会坚持以“服务企业、规范行业、发展产业”为宗旨，倾力打造政企沟通交流平台，推进行业企业品牌指数研究和发布，推动行业生产、质量、安全管理等团体标准体系建设，倡导行业绿色工厂和智能制造，强化行业高技能人才的培养，深化产学研医用学术交流平台，落实行业诚信体系构建，连续11年发布“上海医药行业社会责任报告”。同时，根据国家长三角一体化发展的战略部署和区域内产业一体化发展的内在需要，积极推动长三角医药产业协同发展和战略合作，助推区域医药产业高质量健康发展。

协会倾力打造支持医药产业健康发展的六张服务名片。1、推进企业品牌建设，打造品牌服务名片。协会与上海社会科学院品牌发展研究中心合作推出“上海医药行业企业品牌指数研究”，推动行业 “制造向创造转变、速度向质量转变、产品向品牌转变”。2、倡导科技创新，打造技术服务名片。聚焦药物质量管理体系的短板，对国家标准形成有效补充，协会迄今已发布23个团体标准，其中多个行业团体标准填补了国内外的空白，连续三年获得“上海标准委授予的“上海标准”标识证书。3、坚持需求导向，打造培训服务名片。协会依托上海医药产业高技能人才基地，强化行业高技能人才体系建设，每年完成近万人次专业和技能人员培训，并被国家财政部、人力资源和社会保障部批准为国家高技能人才培养基地。4、推进产学研医用协同，打造学术服务名片。依托《上海医药》杂志学术期刊，积极宣传合理用药，对接产、学、研、医、用开展学术交流，为行业发展、区域医药经济合作提供合作平台。5、开展调查研究，打造咨询服务名片。通过行业发展战略研究、行业统计分析、药品价格监控等，为行业健康发展提供战略咨询服务。6、积极建言献策，打造政企服务名片。发挥企业和政府的桥梁纽带作用，围绕产业变革的重点与难点问题，发挥社会共治职能，源头参与国家相关政策法规制定，开展行业法规政策宣贯，收集整理并及时反映企业的合理诉求，向全国两会及政府部门提出发展对策和意见建议。

协会先后获得中国先进工业行业协会、上海市先进民间组织、上海市三八红旗集体、上海市品牌社会组织、上海“四好商会”、全国“四好商会”及上海市先进行业协会、先进基层党组织等荣誉。